四方を50ｍを超える壁に囲まれた街・シガンシナ地区。
人々は壁の外の巨人から自分たちを守るため、この巨大な壁を作りあげたのだった。
外の世界に憧れる少年・エレンと、彼のよき理解者であるミカサは、壁の中で平和な時を過ごしていた。
そんなある日、壁の外を探索に行った調査兵団が、この町に帰還するのを知る。
調査兵団を“英雄”と呼ぶエレンが見たのは……。