ネタバレします。
組織の黒幕は工藤優作です。
元々組織は阿笠栗助と阿笠定子が作ったやつで、目的は不老不死、肉体若返りです。
ちなみに博士も元組織の発明家。
工藤優作は子供の頃から阿笠夫妻の研究を見ていた。
工藤優作の目的はノンフィクションの小説を書く為。
ちなみにコードネームはナポレオン。
組織名はナイトバロン
ジンやウォッカは組織の本当の目的を知らない
国家制圧とボスから教えられているから。
工藤優作は自分をモリアーティに置き換えてホームズ(コナンと対決している。)