絶対アガサが黒幕！
無職なのに子供達と旅行出来る余裕あるし、発明品だって資金がなきゃ出来ない。。
ウソエイトオーオーだってきっとアガサが作ったんだ！

作者が否定してるから

赤井さんはﾎﾝﾄに死んだのかなぁ?

>>21
ジンがアポトキシン4869を新一に飲ませて殺したつもりが、生きてはいたが体が幼児化しました。阿笠博士にその日起きた事等を話し自分が新一だということを証明しましたよね？
博士が黒幕なら普通その場で殺されるか、ジン達に新一が生存してる事を伝えすぐにでも毛利探偵事務所等に手が回るはずです。
それに黒幕である阿笠博士（仮定）が新一が生きている事を知っているのに、何故組織のデータで工藤新一が生存不明になっていたのですか？何らかの理由で新一を生かしたとなればデータには生存と記録されますよね？
てか%

>>21
ジンがアポトキシン4869を新一に飲ませて殺したつもりが、生きてはいたが体が幼児化しました。阿笠博士にその日起きた事等を話し自分が新一だということを証明しましたよね？
博士が黒幕なら普通その場で殺されるか、ジン達に新一が生存してる事を伝えすぐにでも毛利探偵事務所等に手が回るはずです。
それに黒幕である阿笠博士（仮定）が新一が生きている事を知っているのに、何故組織のデータで工藤新一が生存不明になっていたのですか？何らかの理由で新一を生かしたとなればデータには生存と記録されますよね？
てかデータが警察等に流出し、工藤新一の記録があれば捜索されて組織側からしてみれば厄介な事なので、組織にコナンの正体が割れているのらデータに一切記録を残さない（生かしていることを前提の話）のが妥当では？ほかの人の記録は警察側も必死には捜索しないかもしれませんが、新一はコナンになっても目暮警部とかと電話でやりとりしているので生存、不明、死亡、どんな記録が残ってても疑いが生じるはずですよ？それは身近にいる阿笠博士が一番わかっている事です。


これらから考えれば博士が黒幕では無いと思います。矛盾だらけなのでね

>>24
失敗

アガサ（黒幕）は何故新一（コナン）を生かしているのかと言うと組織の目的の一つが「不老不死の研究」だから、APTX4869の本来の効能"幼児化"は不老不死に関連している。
つまりアガサはこの貴重な実験動物を観察してるってワケ、だから灰原愛も自分の手の届くところに置いてるわけ。
警察に行かない事は博士が一番良く知っているなぜなら「正体がばれると周りに危害が及ぶ」と新一に心理的圧力を掛けたのは・・・

なるほどね。でもそれだけでは博士が黒幕って証拠は全然ありませんよ。
データの件は？コナンが何もしなくても、警察等に組織のデータが流出する可能性はありますよ。
観察してるだけなら黒幕とは限らないですよね？組織の命令で無理矢理アガサ博士にやらせてる可能性もありますし。一応博士ですから。
それに黒幕が観察をする必要性も無いでしょう。まぁ盲点は付いてますけどね。でも黒の組織は完全秘密組織なので新一の推理力、観察力の前にわざわざ組織側から穴を見せるのはおかしくないですか？それを一番理解し、恐れる人物は長年身近に居る阿笠博士です。

一回、阿笠博士とウォッカが出会いそうになった事あるよね。
雪のロッジで。

後、博士が黒幕なら、ベルモッドがわざわざ灰原を拉致するかな？
黒幕差し置いて。

黒幕は警察関係者じゃないかと小生は思う。
根拠はないがな。

もちろん新一が生きていると知ったらジンは殺しに来るでしょう。

以下ウィキ
「もし暗殺者の正体がバレた場合はたとえそれが組織の重要人物であろうとも迷わず消すなど、現場に証拠を全く残さず暗殺を果たすやり方をする（ジン曰く「それが組織のやり方だ」）。」

アガサは貴重な実験体を失いたくない、しかしモチロンそれがばれたら例えボスでも消され掛けない・・だからアガサは組織にも報告はしないし、自身、報告義務はないと思っているのです、
そう、実に危険な橋を渡っているのです。
それがストーリー後半組織にバレ、組織ＶＳ組織を追われたアガサＶＳコナンとなり実に面白いストーリー展開に・・
第二に何故、新一に組織の穴を見せるのか、ですがそれが組織の危険とは考えていないからです。事実、新一が黒の組織のしっぽを掴んだことがありませんし、もし掴んだとしても長年身近にいるアガサなら新一に気づかれず証拠を消すことも、厄介になったら新一自体を消すことも出来るからです。